全新 S-Class 針對一般行駛時、緊急狀況時、事故發生時與事故發生後，依照不同的駕駛與危急狀態，以最高科技的安全配備來避免意外、來降低意外發生的傷害程度。首先於一般行駛時，全新 S-Class 可透過ABS/BAS/ESP、智慧型煞車系統、LED 頭燈、駕駛者注意力輔助系統、胎壓過低警示系統、主動式停車輔助系統、全車三點式安全帶與側風穩定系統，讓車輛盡可能的維持安全行駛狀態；但若意外仍有發生可能，全新 S-Class 則會啟動PRE-SAFE®主動安全防護系統，將安全帶自動緊束、關閉側窗與天窗、前乘客座調整至防潛位置等，準備應付接下來可能發生的碰撞意外。
當意外難以避免而發生，全新 S-Class 會透過位於前、側的氣囊，與側窗氣簾的緩衝，搭配安全帶自動束緊裝置、主動式安全頭枕、高鋼性車體設計與撞擊潰縮區，盡可能的將撞擊力道消弭至最低。而事故發生後，全新S-Class則會自動開啟警示燈、車門解鎖、引擎熄火、燃油切斷、室內燈自動點亮與開啟側窗，來便利救援人員所給予的幫助。此外，全新S-Class 更提升規格，配置了後安全帶氣囊，當發生撞擊事故時，藏於安全帶內的氣囊將會爆開成為乘客與安全帶之間的緩衝，降低乘客胸腔所承受的撞擊力道並達到加強固定的效果，給予後座乘客更高規格的安全保障。
全新 S-Class 也搭載了前擋雨刷系統 (MAGIC VISION CONTROL)，乃是一套革命性的雨刷裝置，該系統將雨刷液噴嘴整合於雨刷片中，在雨刷左右刮刷的過程，同步進行淨水噴灑，除了可有效清除前擋玻璃上的髒污，少有濺起之水花，更不會影響駕駛人行車與視線。
還有許多科技配備乃是車壇創新首見，如 LED 智慧型頭燈、駕駛注意力輔助系統等等。全新 S-Class 全車系皆搭載 LED 頭燈，提供比傳統燈泡更高的亮度、更長久的使用壽命與降低車輛能源消耗等等的優點；S 400以上等級車款更是搭載了LED智慧型頭燈，提供了多達五種模式，包含有主動轉向照明、轉彎輔助照明、鄉村道路、高速公路與濃霧模式等，依照不同行車速度、轉彎角度以及天候狀況，給予最佳的照明度。
智慧型頭燈 (ILS) 除了上述功能之外，還可透過車內攝影機主動調適遠光燈輔助，當對向有來車時可主動變化遠光燈照明範圍，防止光線直射對向駕駛視線，但仍保有部分遠光燈功能，讓對向車輛不會受到光線的干擾而造成行車危險。
駕駛注意力輔助系統，則是透過感知器來偵測駕駛的精神狀況，如發現精神不濟的現象，就會以聲音與圖示來警告駕駛，此系統可於60-200km/h時速間作動，以提升駕駛安全。對於四面環海的台灣用車環境而言，側風穩定輔助系統更是相當實用，透過 ESP 感知器與駕駛系統，可讓車輛維持水平與保持原有行駛路線，只要在 80-220km/h的時速範圍內皆會作動。對於一款車長超過5米的旗艦房車而言，全新 S-Class 所配備的主動停車輔助系統更是實用，只要於時速35km/h 以下系統就會在駕駛有停車需求時，自動找尋適當的停車位、自動控制方向盤轉向等，駕駛僅需控制檔位變換與煞車、油門踏板，將停車的負擔與壓力減至最輕。
另外，值得一提的是選配的新一代夜視輔助系統 (於時速 260km/h內作動)，透過紅外線感應攝影機，將拍攝到的畫面送至處理器，並自動呈現在12.3 吋的儀表顯示幕上，同時，當偵測到有行人(約160m)或動物(約100m)時，畫面將出現彩色視窗輔助框以提醒駕駛注意，同時頭燈將針對行人方向以閃爍方式投射光源(時速高於60km/h)，以提前警示車輛接近。
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